于是，出现了海军史上最著名的追击战，英国舰队于6月22r驶抵那不勒斯，然后驶入莫西那海峡。6月22r，纳尔逊接到情报（错误的情报）称拿破仑已经攻下马耳他，然后离开了马耳他。“如果他们驶过西西里，”纳尔逊给邓达斯写信道，“我相信他们的目的是攻占亚历山大港。” 于是，纳尔逊扬帆直驶亚历山大港。纳尔逊和拿破仑都不知道在6月23r那天，两支舰队事实上相隔仅78英里之遥！可笑的是：一心要追到拿破仑的纳尔逊过于x急，和拿破仑失之j臂，并于6月28r全速赶到了亚历山大港，却根本不见法国舰队的踪影。x急的海军少将也许是得到了什么新的情报，又立即率领舰队朝东北方向的君士坦丁堡驶去。纳尔逊又一次和拿破仑失之j臂。他们谁也不知道，在6月29r那天，驶离亚历山大港的英国舰队和驶向亚历山大港的法国舰队曾经相隔得比6天前更近，只有74英里，仅数小时航程而已。
纳尔逊是在3周之后才得知这次失误的，他咒骂自己倒霉的运气和拿破仑奇迹般的脱险，叹道：“魔鬼的孩子自有魔鬼的好运！”纳尔逊决定一直追到“天涯海角”。在君士坦丁堡匆忙补给之后，他再次调头驶回亚历山大港。
6月27r深夜，由于风力减小，舰队的航速减慢，此时舰队位于埃及西北海岸180英里处，布吕埃斯海军中将命令三桅快舰“朱诺”号先行驶入亚历山大港，与那里的法国领事联系，了解有关形势的详细报告。两天后，就在英国舰队从水平线上消失后数小时，“朱诺”号到达亚历山大港，将领事马嘉隆（就是夏尔·马嘉隆总领事的侄儿）带上船，带到焦急等待着的拿破仑身边。
马嘉隆登上“东方”号后告诉拿破仑：“一支由14艘炮舰组成的英国舰队在‘朱诺’号抵达亚历山大港前离开了亚历山大港……他们可能随时再度出现?