张羽，21岁，清华大学的学生，既是潮流衣服明星发型大帅哥，又是计算机系超级优等生，智商高达惊人的194，他打字后的电脑，火柴都能点燃。
这么一个有一大堆同学暗恋着的帅气小伙子，却拥有一个惊天动地的一大神秘密：他竟然还在玩小儿科的out电脑游戏：神奇宝贝!
这个秘密，除了他，只有和他谈恋爱的美女同学王雪丽知道，当然王雪丽知道消息时，也是下了一大跳。
张羽和王雪丽住在一个40平米的租房，虽然小，但五脏俱全。
这是一个星期六的大白天，王雪丽在客厅里拿手机看小说，张羽打开电脑做作业：安装某程序并注册。这对电脑天才张羽来说，是小菜一碟了，张羽果然只是花了十分钟就注册好了其他同学觉得困难要死的程序。
之后，张羽并没有关机，他点开了gba模拟器。
gba模拟器里面的游戏，只有一个，是神奇宝贝。张羽点开软件。
“啊，神奇宝贝已经有一个月没有玩了，这次要拿到第七个道馆徽章，攻略上说馆主使用火系；要把大岩蛇等级升到50级，铁甲犀牛50级，喷火龙70级，怪力60级。”张羽自言自语道。
“张羽!”门被用力推开了，王雪丽愤怒地说道：“张羽，还是没改了老毛病，都说了多少遍了还不听!”
之后，两个人争吵起来。
“张羽!你敢再玩，我就跟你分手！”
“分手就分手!反正我是要玩神奇宝贝的！”
大约两分钟之后，张羽完全愤怒了，他双手拎起电脑往客厅砸去，笔记本电脑被砸坏了，冒出了越来越大的火焰，火焰在张羽家里猛烈燃烧，很快要烧死张羽了，这时，张羽抱住王雪丽，亲吻了一下，然后纵身跳进了火海。
张羽就因为自己最爱的两样东西而死掉了。
“张羽！张羽！”王雪丽着急得很，眼里看着张羽快要只剩下灰的尸体。王雪丽眼里流出了泪，自己迟早死的，张羽就是死了，千钧一发之际，王雪丽脱下羽绒服，从窗户里爬了下去，爬到了下面一层楼的房间里，没死。
关于王雪丽，也不再说了，反正就是成了一起轰动全国的大事。再说张羽，张羽死了还说?!张羽死是死了，但他转世投胎了。
这是一个医院，是一个不属于这个世界的医院，它位于神奇宝贝世界关都地区的小镇：真新镇上。
医院的妇产科里，一个青年美女：全神奇宝贝最最有名的人：大木博士的女儿大木·仙月生了一个男孩，男孩是谁?就是张羽的转生，上辈子张羽是个超级神奇宝贝迷，这辈子倒好，是神奇宝贝世界的人了。
他叫阿羽，全名千本·羽，以前计划叫做“千本·天”，因为左手上手臂有一块羽毛形状胎记而改叫“千本·羽”。阿羽父亲千本先生大木博士一个助手，为了帮助大木博士考察神奇宝贝的进化而长期居住在大傻谷地带，只有阿羽生日才能和父亲见面。
阿羽有着小孩的外表，却拥有另外一个世界那个电脑天才的智慧。因为阿羽上一辈子就知道神奇宝贝的很多东西，所
以阿羽这辈子三岁就把一本有六百四十九页的厚书《神奇宝贝全知道》读得滚瓜烂熟。
“妈！”三岁的阿羽对妈妈仙月说：“我今天看了《神奇宝贝全知道》的第三百八十四页那只神奇宝贝，它叫裂空坐，龙系，是丰缘地区传说中的飞龙神奇宝贝，他有着绿色一节一节的身体，背上有黑色的条纹，很帅，我觉的它像是一只进化后的绿毛虫，但绿毛虫进化的神奇宝贝是铁甲蛹，我觉得很奇怪。”
仙月听到阿羽的话时，差点摔倒。她虽然很知道儿子很聪明，但儿子三岁大就可以把裂空坐讲得一清二楚，还能概括，仙月就觉得儿子不正常了，特别是最后一句，这是半年前父亲千本先生提出的，而家里没有报纸，阿羽就是自己想出该想法的第二人了。而这个第二人却是一个三岁小孩。
阿羽就是不正常，他五个月大就能看电视，在阿羽五岁生日那天，阿羽看了第105届关都大会的决赛。
双方一个叫天鬼，一个叫飞红。
最终对决一一
“鬼斯，恶之波动！”天鬼下令。
“暴蝾螈，挡住！”
强大的恶之波动，竟然被暴蝾螈的红翼挡住了，伤害约为0！
“暴蝾螈，龙鳞之怒！”飞红下令，龙鳞之怒直接打中鬼斯，鬼斯被撞飞到墙壁上，不能战斗了。
“鬼斯失败，暴蝾螈获胜，胜利者是：凯那市的飞红先生！”
这场决赛，使阿羽也吓了一跳，阿羽在之前看天鬼的比赛中知道，鬼斯是很强的，三十二强比赛中鬼斯一个k了六个，对手还包括一只快龙和一只大钢蛇。
从此，阿羽迷上了暴蝾螈。
“妈，我想使暴蝾螈做我的神奇宝贝。”阿羽请求道，“因为暴蝾螈很厉害。”
仙月又震惊了，一般的小孩子都想要让皮皮、胖丁这种可爱神奇宝贝做自己的神奇宝贝的，唯独阿羽，偏偏要暴蝾螈，攻击到阿羽身上要死掉的！
仙月考虑后说：“可以，但阿羽要多学神奇宝贝知识才可以拥有啊，如果你学得认真，你在七岁生日时会给你暴蝾螈。”
之后，阿羽苦学神奇宝贝知识，五岁那年，个子高的阿羽装成七岁，去神奇宝贝学校学习。
阿羽在学校里交了2个好朋友，一个叫小坎，一个就是圣代。两人都是七岁。小坎和